CDC nisi një konsorcium mbi gjenomikën kombëtare virale

Qendrat Amerikane për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve, CDC, filloi një konsorcium për të filluar një rrjet kombëtar të laboratorëve të sekuencave i cili do të shpejtojë lëshimin e të dhënave të sekuencës SARS-CoV-2 në domenin publik. Lirimi i shpejtë i të dhënave të sekuencës së koronavirusit të hapur do të ndihmojë në udhëzimin COVID-19 reagimi i shëndetit publik, nxit inovacionin dhe zbulimin, dhe kuptimin e avancuar të kësaj dhe pandemive të ardhshme.

kjo Sekuencat SARS-CoV-2 për përgjigjen ndaj urgjencës në shëndetin publik, epidemiologjinë dhe mbikëqyrjen (Sferat) konsorcium, i cili do të zgjerojë shumë përdorimin e renditja e plotë e gjenomit (WGS) të virusit COVID-19. SPHERES do të sigurojë të dhëna konsekuente, të sekuencës në kohë reale, për ekipet e reagimit të shëndetit publik duke hetuar raste dhe grupe të COVID-19 në të gjithë vendin.

Ky konsorcium i ri do t'i ndihmojë ata të kuptojnë më mirë se si po përhapet virusi, si në shkallë kombëtare dhe në komunitetet e tyre lokale. Nga ana tjetër, të dhëna më të mira do të ndihmojnë zyrtarët e shëndetit publik të ndërpresin zinxhirët e transmetimit, të parandalojnë raste të reja të sëmundjes dhe të mbrojnë dhe të shpëtojnë jetë.

“SH.B.A. është lider në botë në renditjen e shpejtë të gjenomit të avancuar. Kjo përpjekje e koordinuar në të gjithë laboratorët tanë të shëndetit publik publik, privat, klinik dhe akademik do të luajë një rol jetësor në kuptimin e transmetimit, evolucionit dhe trajtimit të SARS-CoV-2. Unë kam besim se mendjet tona më të mira, më të afta po punojnë së bashku për të na ndihmuar të shpëtojmë jetë sot dhe nesër, "tha Drejtori i CDC Robert Redfield, MD

Ndjekja e virusit COVID-19 ndërsa evoluon

Të dhënat e sekuencës gjenomike mund të japin një pasqyrë të pashembullt të biologjisë së SARS-CoV-2, virusit që shkakton COVID-19 dhe të ndihmojnë në përcaktimin e peizazhit ndryshues të pandemisë. Duke renditur viruset nga e gjithë Shtetet e Bashkuara, CDC dhe autoritetet e tjera të shëndetit publik mund të monitorojnë ndryshimet e rëndësishme në virus dhe të përdorin këtë informacion për të drejtuar gjurmimin e kontakteve, përpjekjet për zbutjen e shëndetit publik dhe strategjitë e kontrollit të infeksionit.

Konsorciumi SPHERES është një përpjekje ambicioze për të koordinuar sekuencimin e gjenomit SARS-CoV-2, duke organizuar dhjetëra përpjekje më të vogla, individuale në një rrjet të vetëm, të shpërndarë të laboratorëve, institucioneve dhe korporatave. Konsorciumi kombinon ekspertizën, teknologjinë dhe burimet e 40 departamenteve të shëndetit publik shtetëror dhe lokal, disa laboratorë të mëdhenj klinikë dhe mbi dy duzina institucionesh bashkëpunuese në të gjithë qeverinë federale, akademinë dhe sektorin privat.

SPHERES do të vendosë praktikat më të mira dhe standardet e të dhënave konsensuale, do të përshpejtojë ndarjen e të dhënave të hapura dhe do të krijojë një grup burimesh dhe ekspertize për të ndihmuar në sjelljen e teknologjisë më të përparuar në përgjigjen kombëtare të COVID-19.

Të dhënat e Sferave të hapura, të ndara

Anëtarët e konsorciumit ndajnë një angazhim për ndarjen e shpejtë të sekuencave të hapura. Ata planifikojnë të paraqesin të gjitha të dhënat e dobishme të sekuencës në depot publike në Bibliotekën Kombëtare të Mjekësisë, Qendra Kombëtare për Informacionin e Bioteknologjisë (NLM / NCBI), Iniciativa Globale për Ndarjen e të Dhënave të Gripit të Shpendëve (GISAID) dhe depot e tjera të sekuencës publike. Kjo do të ndihmojë në sigurimin që të dhënat e sekuencave virale nga e gjithë Shtetet e Bashkuara të Amerikës të jenë në dispozicion me shpejtësi për vendimmarrje të shëndetit publik dhe të lira të arritshme për studiuesit kudo.

Anëtarët e konsorciumit përfshijnë:

Agjencitë federale dhe laboratorët

Qendrat për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve, Zyra e Zbulimeve të Avancuara Molekulare

Laboratori Kombëtar i Argonit

Agjencia e Shëndetit të Mbrojtjes, Global Infektive Sëmundje mbikëqyrje

Food and Drug Administration

Laboratori Kombëtar Lawrence Berkeley

Los Alamos National Laboratory

Instituti Kombëtar i Alergjisë dhe Sëmundjeve Infektive, Zyra e Gjenomikës dhe Teknologjisë së Avancuar

Instituti Kombëtar i Standardeve dhe Teknologjisë

Biblioteka Kombëtare e Mjekësisë Qendra Kombëtare e Informacionit Bioteknologjik

Walter Reed Instituti i Kërkimeve

Laboratorët e shëndetit publik shtetëror / lokal

Arizona

Kaliforni

Delaware

District of Columbia

Florida

Hawaii

Maine

Maryland

Massachusetts

Michigan

Minesota

North Carolina

North Dakota

Nevada

New Mexico

Nju Jork

Utah

Virginia

Washington

Wisconsin

Wyoming

Institucionet akademike

Universiteti Baylor

Cornell University

Fred Hutchinson Qendra e Kërkimit të Kancerit

Shkolla e Mjekësisë në Malin Sinai

New York University

Universiteti i Arizonës Veriore

Universiteti i Buffalo

Universiteti i Kalifornisë, Berkeley

Universiteti i Kalifornisë, Davis

Universiteti i Kalifornisë, Irvine

Universiteti i Kalifornisë, Los Anxhelos

Universiteti i Kalifornisë, San Francisco

Universiteti i Kalifornisë, Santa Cruz

Universiteti i Çikagos

Universiteti i Maryland

Universiteti i Minesotës

Universiteti i Nebraskës

Universiteti i New Mexico

Universiteti i Uashingtonit

Yale University

korporatat

Diagnostifikimi Abbott

bioMerieux

Gjenomika e Ngjyrave

Gingko Bioworks

IDNj

Në-Q-Tel

Laborator

Një Kodeks

Oxford Nanopore Technologies

Biosciencat e Paqësorit

QIAGEN

Diagnostika e kërkimit

Me të vërtetë Shkencat e Jetës

Emrat e korporatave jepen vetëm për qëllime informacioni dhe përfshirja e tyre këtu nuk përbën miratim të korporatave ose ndonjë prej produkteve ose shërbimeve të tyre tregtare nga Qendrat Amerikane për Kontrollin dhe Parandalimin e Sëmundjeve.

Institutet hulumtuese të shëndetit publik jofitimprurës

Shoqata e Laboratorëve të Shëndetit Publik

Bill dhe Melinda Gates Foundation

Instituti i gjerë

Chan Zuckerberg BioHub

Instituti Craig Venter

Aleanca e Shëndetit Publik për Epidemiologjinë Gjenomike

Kërkime Scripps

Laboratori Jackson

Instituti i Kërkimeve të Gjenomikës Përkthimore - Veri

Fondacioni Walder

Për gjashtë vitet e kaluara, Zyra e Programit të Zbulimit të Avancuar Molekular të CDC-së ka investuar në laboratorë federalë dhe shtetërorë të shëndetit publik për të zgjeruar përdorimin e gjenomikës së patogjenëve dhe teknologjive të tjera të përparuara laboratorike për mbikëqyrjen e sëmundjes infektive dhe përgjigjen e shpërthimit. Investimi aktual i konsorciumit synon të shpëtojë jetë në pandeminë SARS-CoV-2 dhe të përgatisë Shtetet e Bashkuara dhe botën për reagimin e ardhshëm të pandemisë.

Për të mësuar më shumë rreth renditjes gjenomike ose punës së CDC në zbulimin e avancuar molekular, vizitoni https://www.cdc.gov/amd/